O Linhares Futebol Clube é um time da cidade de Linhares, região Norte do Espírito Santo, fundado em 16 de agosto de 2001, pelo ex-jogador e técnico Adauto Menegussi. O clube, inicialmente, tinha uma forte ligação com as categorias de base, revelando jogadores para clubes de todo o Brasil e do exterior, pois surgiu da Escolinha de Futebol Companhia de Craque.
Vestindo um uniforme verde claro com faixas pretas na lateral, homenageando as cores da escolinha de origem, o clube disputava pela primeira vez a segunda divisão do Campeonato Capixaba, em 2004. No ano seguinte (2005), o Linhares mudou as cores para azul e branco, igual a bandeira de sua cidade. Neste mesmo ano, o Coruja Azul conquistava a vaga na elite do futebol capixaba, chegando a final do primeiro turno.
Em 2007, foi histórico para o time do interior do Espírito Santo. A competição que parecia perdida no primeiro turno, o Linhares Futebol Clube se recupera e vence o returno do Capixabão primeira divisão, conquistando o primeiro título a nível estadual, além da vaga na Série C do Campeonato Brasileiro de 2007 e na Copa do Brasil de 2008.
Em 2010, o Linhares disputou a Copa Espírito Santo, realizando uma boa campanha, porém finalizou a competição nas semifinais. Em 2011 e 2014 o clube chegou às finais, levando para casa os troféus de vice-campeão. No ano de 2017, o clube foi rebaixado à segunda divisão do Estadual Capixaba sem ganhar nenhum ponto, abrindo mão de participar do Capixabão Série B de 2018.
É importante lembrar que, o Linhares Futebol Clube não possui nenhuma ligação com o extinto Linhares Esporte Clube tetracampeão capixaba na década de 90.
Atual presidente: Adauto Menegussi
Diretor de futebol: Itajiba Marques
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